Unter dem Motto "Die Akten gehören uns!" beteiligte Bohley sich im September 1990 an der spektakulären Besetzung des Ministeriums für Staatssicherheit (MfS) und wirkte damit maßgeblich an der Öffnung der Unterlagen der DDR-Staatssicherheit mit. Bohley warnte stets vor einer Verharmlosung der SED-Diktatur. Den Prozess der deutschen Vereinigung nach dem 3. Oktober 1990 begleitete sie kritisch-distanziert.