| Datum | Begegnung | Ergebnis |
| 10.02.2012 | Preußen Münster - Werder Bremen II | 0:0 |
| 11.02.2012 | Wacker Burghausen - VfL Osnabrück | -- |
| 11.02.2012 | 1. FC Saarbrücken - VfB Stuttgart II | 0:0 |
| 11.02.2012 | 1. FC Heidenheim - SV Babelsberg 03 | 5:0 |
| 11.02.2012 | Kickers Offenbach - Carl Zeiss Jena | -- |
| 11.02.2012 | SpVgg Unterhaching - Rot-Weiß Oberhausen | -- |
| 11.02.2012 | SV Sandhausen - Chemnitzer FC | -- |
| 11.02.2012 | SV Wehen Wiesbaden - Arminia Bielefeld | -- |
| 11.02.2012 | Jahn Regensburg - SV Darmstadt 98 | -- |
| 11.02.2012 | Rot-Weiß Erfurt - VfR Aalen | -- |
| Platz | Mannschaft | ges. | G | U | V | Tore | Diff. | Punkte |
| 1 | VfR Aalen | 24 | 12 | 7 | 5 | 32:22 | +10 | 43 |
| 2 | SV Sandhausen | 24 | 12 | 7 | 5 | 35:26 | +9 | 43 |
| 3 | Jahn Regensburg | 23 | 10 | 8 | 5 | 37:22 | +15 | 38 |
| 4 | 1. FC Heidenheim | 24 | 10 | 7 | 7 | 31:24 | +7 | 37 |
| 5 | 1. FC Saarbrücken | 25 | 8 | 12 | 5 | 42:32 | +10 | 36 |
| 6 | Rot-Weiß Erfurt | 24 | 9 | 9 | 6 | 31:26 | +5 | 36 |
| 7 | Wacker Burghausen | 23 | 8 | 11 | 4 | 36:29 | +7 | 35 |
| 8 | Chemnitzer FC | 24 | 10 | 5 | 9 | 31:29 | +2 | 35 |
| 9 | VfB Stuttgart II | 24 | 8 | 10 | 6 | 27:29 | -2 | 34 |
| 10 | Kickers Offenbach | 23 | 9 | 6 | 8 | 28:25 | +3 | 33 |
| 11 | Preußen Münster | 24 | 7 | 11 | 6 | 25:26 | -1 | 32 |
| 12 | VfL Osnabrück | 22 | 6 | 11 | 5 | 24:20 | +4 | 29 |
| 13 | SV Wehen Wiesbaden | 23 | 7 | 8 | 8 | 26:28 | -2 | 29 |
| 14 | Arminia Bielefeld | 24 | 7 | 8 | 9 | 32:38 | -6 | 29 |
| 15 | SV Babelsberg 03 | 25 | 7 | 8 | 10 | 33:41 | -8 | 29 |
| 16 | SpVgg Unterhaching | 23 | 8 | 4 | 11 | 38:38 | 0 | 28 |
| 17 | SV Darmstadt 98 | 24 | 7 | 6 | 11 | 31:34 | -3 | 27 |
| 18 | Rot-Weiß Oberhausen | 24 | 4 | 9 | 11 | 21:31 | -10 | 21 |
| 19 | Carl Zeiss Jena | 22 | 4 | 6 | 12 | 24:43 | -19 | 18 |
| 20 | Werder Bremen II | 25 | 3 | 9 | 13 | 24:45 | -21 | 18 |
| Datum | Begegnung |
| 17.02.2012 | VfL Osnabrück - 1. FC Saarbrücken |
| 18.02.2012 | SV Wehen Wiesbaden - SV Sandhausen |
| 18.02.2012 | VfB Stuttgart II - Preußen Münster |
| 18.02.2012 | VfR Aalen - Wacker Burghausen |
| 18.02.2012 | Arminia Bielefeld - Jahn Regensburg |
| 18.02.2012 | Rot-Weiß Oberhausen - Chemnitzer FC |
| 18.02.2012 | Carl Zeiss Jena - SpVgg Unterhaching |
| 18.02.2012 | SV Babelsberg 03 - Kickers Offenbach |
| 18.02.2012 | Werder Bremen II - 1. FC Heidenheim |
| 19.02.2012 | SV Darmstadt 98 - Rot-Weiß Erfurt |
*Gegen Rot Weiss Ahlen wurde nach Saisonende ein Insolvenzverfahren eröffnet. Damit steht laut Statuten des Deutschen Fußball Bundes (DFB) der Abstieg in die Regionalliga fest. Das sportliche abgestiegene Wacker Burghausen bleibt in der Dritten Liga.
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