Knorpelfischen pflanzen sich wie Säugetiere durch innere Befruchtung fort - Männchen und Weibchen kopulieren. Männliche Haie besitzen ein paariges penisartiges Organ, das Klasper genannt wird. Die Klasper sind ein Stück umgewandelte Bauchflosse, röhrenförmig eingerollt und an den Enden überlappend. Sie sind von außen gut sichtbar, so dass man das Geschlecht bei erwachsenen Tieren gut erkennen kann. Mit zunehmendem Alter und nahender Geschlechtsreife wachsen die Klasper und werden durch die Einlagerung von Kalksalzen verstärkt. Die Geschlechtsöffnung des Weibchens wird Kloake genannt. Bei der Paarung beißt der männliche Hai in die Brustflossen des Weibchens, um sich festzuhalten - dabei kommt es häufig zu Verletzungen. Vorwiegend am Boden lebende bewegliche Haie schlingen ihren Körper um den des Weibchens. Manche Haiarten haben eine Struktur entwickelt, die der Säugetierplazenta sehr ähnlich ist. Viele Knorpelfische wie die Haie gebären lebende Junge, andere, wie Echte Rochen und Chimären legen Eier.
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