Dienstag, 29. Mai 2012

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Virus-Taxonomie

Als Virus-Taxonomie bezeichnet man die international verbindliche Benennung von Viren, Virusfamilien und -gattungen. Die Entscheidung über verschiedene Taxa wird von einem internationalen Gremium, dem International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), beraten und getroffen.

Die Virus-Taxonomie ist ein an die Taxonomien von Pflanzen und Tieren angelehnter Versuch, die Vielfalt viraler und subviraler Entitäten (auch Prionen und Retrotransposons) systematisch und einheitlich zu ordnen. Sie darf nicht mit der weiter gefassten Virusklassifikation verwechselt werden, bei der verschiedene Eigenschaften von Viren zur Einteilung herangezogen werden können (zum Beispiel nur Genomstruktur, Baltimore-Klassifikation, Wirtsspezies, Übertragungsart etc.).

In der derzeit gültigen Veröffentlichung des ICTV (8. Bericht 2004) finden sich viele sonst vielleicht übliche Bezeichnungen nicht, da über deren taxonomische Zuordnung noch keine einheitliche Meinung gefunden werden konnte. Über die anerkannten Kriterien der taxonomischen Einteilung siehe ICTV.

DNA-Viren

Doppelsträngige DNA-Viren (dsDNA: double stranded DNA)

  • Genus T4-ähnliche Viren
  • Genus P1-ähnliche Viren
  • Genus P2-ähnliche Viren
  • Genus Mu-ähnliche Viren
  • Genus SPO1-ähnliche Viren
  • Genus φH-ähnliche Viren
  • Genus λ-ähnliche Viren
  • Genus T1-ähnliche Viren
  • Genus T5-ähnliche Viren
  • Genus L5-ähnliche Viren
  • Genus c2-ähnliche Viren
  • Genus ψM1-ähnliche Viren
  • Genus φC31-ähnliche Viren
  • Genus N15-ähnliche Viren
  • Genus T7-ähnliche Viren
  • Genus P22-ähnliche Viren
  • Genus Φ29-ähnliche Viren
  • Genus N4-ähnliche Viren
  • Ordnung nicht bestimmt:
  • Familie Fuselloviridae
  • Genus Fusellovirus
nicht-gruppiertes Genus:
  • Genus Salterprovirus
  • Genus Orthopoxvirus
  • Genus Parapoxvirus
  • Genus Avipoxvirus
  • Genus Capripoxvirus
  • Genus Leporipoxvirus
  • Genus Suipoxvirus
  • Genus Molluscipoxvirus
  • Genus Yatapoxvirus
  • Unterfamilie Entomopoxvirinae
  • Genus Alphaentemopoxvirus
  • Genus Betaentemopoxvirus
  • Genus Gammaentemopoxvirus
  • Genus Iridovirus
  • Genus Chloriridovirus
  • Genus Ranavirus
  • Genus Lymphocystivirus
  • Genus Megalocytivirus
  • Genus Chlorovirus
  • Genus Coccolithovirus
  • Genus Prasinovirus
  • Genus Prymnesiovirus
  • Genus Phaeovirus
  • Genus Raphidovirus
  • Genus Nucleopolyhedrovirus
  • Genus Granulovirus
  • Familie Nimaviridae
  • Genus Whispovirus
  • Genus Cytomegalovirus
  • Genus Muromegalovirus
  • Genus Roseolovirus
  • Genus Proboscivirus
  • Familie Alloherpesviridae
  • Genus Ictalurivirus
  • Ordnung nicht bestimmt:
  • Genus Mastadenovirus
  • Genus Aviadenovirus
  • Genus Atadenovirus
  • Genus Siadenovirus
nicht-gruppiertes Genus:
  • Genus Rhizidiovirus
  • Genus Ichnovirus
  • Genus Brachovirus
  • Familie Megaviridae

Einzelsträngige DNA-Viren (ssDNA: single stranded DNA)

  • Familie Inoviridae
  • Genus Inovirus
  • Genus Plectrovirus
  • Genus Microvirus
  • Genus Chlamydiamicrovirus
  • Genus Bdellomicrovirus
  • Genus Spiromicrovirus
  • Familie Geminiviridae
  • Genus Mastrevirus
  • Genus Curtovirus
  • Genus Topocuvirus
  • Genus Begomovirus
  • Genus Circovirus
  • Genus Gyrovirus
nicht-gruppiertes Genus:
  • Genus Anellovirus
  • Familie Nanoviridae
  • Genus Nanovirus
  • Genus Babuvirus
  • Unterfamilie Densovirinae
  • Genus Densovirus
  • Genus Iteravirus
  • Genus Brevidensovirus
  • Genus Pefudensovirus

DNA und RNA revers transkribierende Viren

Doppelsträngige DNA RT-Viren (dsDNA-RT)

  • Genus Orthohepadnavirus
  • Genus Avihepadnavirus
  • Familie Caulimoviridae
  • Genus Caulimovirus
  • Genus Petuvirus
  • Genus Soymovirus
  • Genus Cavemovirus
  • Genus Badnavirus
  • Genus Tungrovirus

Einzelsträngige RNA RT-Viren (ssRNA-RT)

  • Familie Pseudoviridae
  • Genus Pseudovirus
  • Genus Hemivirus
  • Genus Sirevirus
  • Familie Metaviridae
  • Genus Metavirus
  • Genus Errantivirus
  • Genus Semotivirus

RNA-Viren

Doppelsträngige RNA-Viren (dsRNA) (double stranded RNA)

  • Familie Cystoviridae
  • Genus Cystovirus
  • Genus Orthoreovirus
  • Genus Orbivirus
  • Genus Rotavirus
  • Genus Coltivirus
  • Genus Aquareovirus
  • Genus Cypovirus
  • Genus Fijivirus
  • Genus Phytoreovirus
  • Genus Oryzavirus
  • Genus Seadornavirus
  • Genus Idnoreovirus
  • Genus Mycoreovirus
  • Familie Totiviridae
  • Genus Totivirus
  • Genus Giardiavirus
  • Genus Leishmaniavirus
  • Familie Partitiviridae
  • Genus Partitivirus
  • Genus Alphacryptovirus
  • Genus Betacryptovirus
  • Familie Chrysoviridae
  • Genus Chrysovirus
  • Familie Hypoviridae
  • Genus Hypovirus
nicht-gruppiertes Genus
  • Genus Endornavirus

Einzel-(−)-Strang-RNA-Viren (ss(−)RNA: negative single-stranded RNA)

  • Genus Vesiculovirus
  • Genus Lyssavirus
  • Genus Ephemerovirus
  • Genus Novirhabdovirus
  • Genus Cytorhabdovirus
  • Genus Nucleorhabdovirus
  • Genus Pneumovirus
  • Genus Metapneumovirus
nicht-gruppierte Genera
  • Genus Varicosavirus
  • Genus Ophiovirus
  • nicht-gruppierte Familien (segmentierte negativsträngige RNA-Viren)
  • Genus Orthobunyavirus
  • Genus Hantavirus
  • Genus Nairovirus
  • Genus Phlebovirus
  • Genus Tospovirus
nicht-gruppierte Genera:

Einzel (+)-Strang-RNA-Viren (ss(+)RNA: positive single stranded RNA or mRNA-like)

  • Familie Dicistroviridae
  • Genus Cripavirus
  • Familie Marnaviridae
  • Genus Marnavirus
  • Familie Sequiviridae
  • Genus Sequivirus
  • Genus Waikavirus
  • Familie Comoviridae
  • Genus Comovirus
  • Genus Fabavirus
  • Genus Nepovirus
nicht-gruppierte Genera:
  • Genus Iflavirus
  • Genus Sadwavirus
  • Genus Cheravirus
  • Ordnung nicht bestimmt:
  • Familie Leviviridae
  • Genus Levivirus
  • Genus Allolevivirus
  • Familie Narnaviridae
  • Genus Narnavirus
  • Genus Mitovirus
  • Familie Potyviridae
  • Genus Potyvirus
  • Genus Ipomovirus
  • Genus Macluravirus
  • Genus Rymovirus
  • Genus Tritimovirus
  • Genus Bymovirus
  • Genus Lagovirus
  • Genus Norovirus
  • Genus Sapovirus
  • Genus Vesivirus
  • Familie Astroviridae
  • Genus Avastrovirus
  • Genus Mamastrovirus
  • Familie Nodaviridae
  • Genus Alphanodavirus
  • Genus Betanodavirus
  • Familie Tetraviridae
  • Genus Betatetravirus
  • Genus Omegatetravirus
nicht-gruppiertes Genus:
  • Genus Sobemovirus
  • Familie Luteoviridae
  • Genus Luteovirus
  • Genus Polerovirus
  • Genus Enamovirus
nicht-gruppiertes Genus:
  • Genus Umbravirus
  • Familie Tombusviridae
  • Genus Dianthovirus
  • Genus Tombusvirus
  • Genus Aureusvirus
  • Genus Avenavirus
  • Genus Carmovirus
  • Genus Necrovirus
  • Genus Panicovirus
  • Genus Machlomovirus
  • Familie Roniviridae
  • Genus Okavirus
  • Ordnung nicht bestimmt:
nicht-gruppierte Spezies: GB-Virus A/B/C
nicht-gruppierte Genera:
  • Genus Tobamovirus
  • Genus Tobravirus
  • Genus Hordeivirus
  • Genus Furovirus
  • Genus Pomovirus
  • Genus Pecluvirus
  • Genus Benyvirus
  • Familie Bromoviridae
  • Genus Alfamovirus
  • Genus Bromovirus
  • Genus Cucumovirus
  • Genus Ilarovirus
  • Genus Oleavirus
nicht-gruppierte Genera:
  • Genus Ourmiavirus
  • Genus Idaeovirus
  • Familie Tymoviridae
  • Genus Tymovirus
  • Genus Marafivirus
  • Genus Maculavirus
  • Familie Closteroviridae
  • Genus Closterovirus
  • Genus Ampelovirus
  • Genus Crinivirus
  • Familie Flexiviridae
  • Genus Potexvirus
  • Genus Mandarivirus
  • Genus Allexivirus
  • Genus Carlavirus
  • Genus Foveavirus
  • Genus Capillovirus
  • Genus Vitivirus
  • Genus Trichovirus
  • Familie Barnaviridae
  • Genus Barnavirus

Subvirale Erreger

Viroide

  • Familie Avsunviroidae
  • Genus Avsunviroid
  • Genus Elaviroid
  • Genus Pelamoviroid
  • Familie Pospiviroidae
  • Genus Apscaviroid
  • Genus Cocadviroid
  • Genus Coleviroid
  • Genus Hostuviroid
  • Genus Pospiviroid

Satelliten

  • Satellite Viruses (Satelliten-Viren)
  • Satellite Nucleic Acids (Satelliten-Nukleinsäuren)

Prionen

  • Mamalian Prions (Säugetier-Prionen)
  • Fungal Prions (Pilz-Prionen)

Vorgeschlagene oder nicht-offizielle Virustaxa

Die Virus-Taxonomie unterliegt ständigen Veränderungen, die einerseits durch neu entdeckte Viren (speziell in marinen und extremen Lebensräumen) bedingt sind, andererseits dadurch, dass aufgrund immer umfangreicherer Sequenzdaten neue verwandtschaftliche Beziehungen erschlossen werden. In der Regel werden Vorschläge für neue Virustaxa von internationalen Arbeitsgruppen dem ICTV unterbreitet, die allerdings schon vor ihrer offiziellen Übernahme in Publikationen oder Datenbanken (auch denen des NCBI) verwendet werden. Meist sind dies serologisch begründete Serogruppen innerhalb von Gattungen und Familien, aber auch neu geschaffene Virusordnungen (Picornavirales, Retrovirales) und -familien (z.B. Secoviridae).

Literatur

C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004

Weblinks

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Diese Seite wurde zuletzt am 15. Oktober 2011 um 16:48 Uhr geändert.

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